تلاش ها برای ایجاد یک واحد دانشگاهی دولتی در گناباد در سال 1389 وارد مرحله جدیدی شد. نماینده محترم وقت شهرستان در مجلس شورای اسلامی طبق نام‌ه‎ای به ریاست محترم جمهوری خواستار ایجاد یک واحد دانشگاهی دولتی وابسته به وزارت علوم، تحقیقات و فناوری شد. این مرکز تحت عنوان مرکز آموزش عالی دولتی گناباد (دانشکده فنی و مهندسی)، طبق دستور ریاست محترم جمهوری (موضوع نامه شماره 232605 مورخ 1388.12.3)، تأیید وزیر محترم علوم، تحقیقات و فناوری (موضوع نامه شماره 21872، مورخ 88.12.8) و موافقت اصولی شورای گسترش آموزش عالی (موضوع نامه شماره 22/77692 مورخ 1389.10.27) از سال 1389 تأسیس شد. و در نهایت طبق موافقت نهایی شورای گسترش آموزش عالی در اواخر مرداد ماه 90 و پیگیری‌های مجدانه نمایندگان محترم شهرستان، امام جمعه محترم، نماینده محترم مجلس وقت، فرماندار محترم وقت و دست‎‌اندرکاران، این مرکز رسماً با پذیرش 72 دانشجو در رشته مهندسی کامپیوتر گرایش نرم‌افزار (کارشناسی پیوسته) و از طریق تکمیل ظرفیت آزمون سراسری(بهمن ماه1390) و زیر نظر مستقیم وزارت علوم، تحقیقات و فناوری فعالیت آموزشی خود را آغاز کرد.

تا پایان سال تحصیلی 92-91 این مرکز تنها دارای 3 رشته در مقطع کارشناسی پیوسته: مهندسی کامپیوتر گرایش نرم‎‎‌‎افزار، مهندسی مکانیک و شیمی کاربردی، 300 نفر دانشجو، 10 کارمند، 32 نفر عضو هیأت علمی و فضاهای آموزشی و خوابگاهی بالغ بر 9500 متر مربع بوده است.

مرکز آموزش عالی گناباد بعد از سه ترم تحصیلی از شروع فعالیت خود(تقریباً 17 ماه) و در اواخر تابستان سال 92 با توجه به تلاش خستگی‎ناپذیر مسئولین به مجتمع آموزش عالی گناباد ارتقا یافت.

به حول قوه الهی و با پیگیری‎‌های شبانه‎‌روزی که در مجتمع آموزش عالی گناباد صورت گرفته است، در سال تحصیلی (94-1393) مجتمع آموزش عالی گناباد در 17 رشته تحصیلی (آمار و کاربردها، ریاضیات و کاربردها، شیمی کاربردی، مهندسی تولیدات گیاهی( گیاهان داروئی و معطر)، مهندسی برق(قدرت)، مهندسی کامپیوتر(نرم افزار)، مهندسی کامپیوتر(فناوری اطلاعات)، مهندسی عمران، مهندسی معدن، مهندسی مکانیک(طراحی جامدات)، مهندسی مواد(سرامیک)، مهندسی شیمی، مهندسی صنایع، زمین شناسی، مدیریت صنعتی، زبان و ادبیات انگلیسی و حقوق) و در دو نوبت روزانه و شبانه مجموعاً 2100 نفر دانشجو مشغول به تحصیل می‌باشند.

طبق موافقت وزارت علوم، تحقیقات و فناوری، این مجتمع برای مهرماه 94، برای 20 رشته‎: آمار و کاربردها، ریاضیات و کاربردها، شیمی کاربردی، مهندسی تولیدات گیاهی( گیاهان داروئی و معطر)، مهندسی برق(قدرت)، مهندسی کامپیوتر(نرم افزار)، مهندسی کامپیوتر(فناوری اطلاعات)، مهندسی عمران، مهندسی معدن، مهندسی مکانیک(طراحی جامدات)، مهندسی مواد(سرامیک)، مهندسی شیمی، مهندسی صنایع، زمین شناسی، مدیریت صنعتی، زبان و ادبیات انگلیسی، حقوق، مهندسی منابع طبیعی(مدیریت مناطق خشک و بیابانی)، باستان‎‌شناسی و آموزش زبان انگلیسی اقدام به پذیرش دانشجو کرد.

هم‎‌اکنون مجتمع آموزش عالی گناباد دارای 24 رشته آموزشی می‌‎باشد. امید می‌رود در افق چند سال آینده بر اساس پیش‌بینی‌های انجام شده طبق برنامه راهبردی تدوین شده، در چارچوب اقتصاد مقاومتی و برنامه‎‌های توسعه کشور، این مجتمع راه‎‌گشای مشکلات منطقه باشد و به عنوان یک دانشگاه موفق در خراسان رضوی مطرح گردد.